1、贯彻执行党和国家有关科技工作的方针政策和法律法规；受委托研究起草全市科技管理的地方性法规、规章草案，经审议通过后组织实施。
2、研究制定全市科技体制改革和技术创新的方针、政策、措施；指导、协调、督查全市科研院所体制改革工作；归口管理全市技术市场、民营科技工作，负责技术合同法实施工作，指导科技中介机构工作和科技第三产业的发展；组织实施全市技术创新体系和科技服务体系建设。
3、研究确定全市科技优先发展领域；组织制订全市科技中、长期发展规划与计划；组织编制全市高新技术产业发展规划；负责全市科技三项费用、科技事业费、科技成果转化资金的管理；组织全市科技型中、小企业技术创新基金项目的推荐；会同有关部门对市科技风险投资资金的使用进行指导与管理。
4、组织实施“科教兴市”战略方案，承担市“科教兴市”领导小组办公室日常工作；指导、协调全市各部门、各主要行业和各区、县（市）科技管理工作；组织开展科技兴企、科技兴农和科技创先活动，协同有关部门推动全市经济和社会事业的科技进步。
5、归口管理全市科技计划工作，编制并实施年度科技发展计划，指导实施国家、省下达和市计划确定的科技攻关、科研、“星火”、“火炬”、新产品开发试制、成果推广、实验基地等重点科技项目。
6、归口管理全市科技成果的审核、认定、验收、鉴定工作；承担市高新技术产业发展领导小组办公室的日常工作；负责全市高新技术企业（杭州高新技术产业开发区内的企业除外）、成果、产品、项目的认定、申报与考核；负责全市科学技术奖励工作。
7、归口管理全市软科学研究、科技信息、科技统计、科技档案和科技保密工作；协调全市科学技术普及工作。
8、归口管理全市科技外事工作，制订并组织实施科技合作与交流计划，会同有关部门组织技术出口、先进技术引进和消化吸收创新工作。
9、负责全市地震和防震减灾工作，承担市防震减灾领导小组办公室的日常工作。
10、管理、协调全市知识产权和专利保护工作，负责知识产权和专利执法监督，依法处理有关纠纷。
11、协同有关部门制订有关科技人员政策，参与有关科技人员的管理与培养。
12、承办市政府交办的其他事项。